Не каждый «отсутствующий» SMN1 означает СМА: редкие варианты и новые выводы

Во многих странах, в том числе и в России, проводят неонатальный скрининг спинальной мышечной атрофии (СМА). Он позволяет быстро диагностировать и проводить досимптоматическое лечение младенцев с биаллельными делециями гена SMN1. Стандартный анализ выявляет около 95% случаев, определяя отсутствие экзона 7 гена SMN1. Однако редкие варианты последовательности могут искажать результат.

Авторы статьи в American Journal of Human Genetics описали двух новорождённых в Германии и Австралии, у которых с помощью скрининга новорожденных был выявлен дефицит гена SMN1, но впоследствии обнаружили наличие одной его копии с 4-нуклеотидной делецией. У одного из этих детей дополнительно выявили одну копию SMN2.

Длинная ПЦР и секвенирование по Сэнгеру выявили разные 4-нуклеотидные делеции в 7-м экзоне SMN1. Обе мутации нарушали участок связывания праймера в стандартном скрининговом тесте и приводили к сдвигу рамки считывания. Поэтому тест «не видел» сохранённую копию гена.

Множество анализов продемонстрировали сохранение сплайсинга экзона 7, заметное снижение количества белка SMN, но его термостабильность оставалась сопоставимой с нормой. Клинически оба ребёнка в возрасте двух лет оставались здоровыми, без признаков СМА. Лечение не назначали.

Исследователи изучили популяционные данные и считают, что около 800 человек европейского происхождения могут иметь подобные варианты гена SMN1 с 4-нуклеотидной делецией. Ни один из них не описан как пациент с СМА.

Указанные наблюдения ставят под сомнение постулат, что утрата полноразмерного SMN неизбежно ведёт к СМА. Учёные предполагают, что даже очень низкие уровни новой выявленной изоформы SMN могут обеспечивать нормальное моторное развитие.

На практике: При положительном результате скрининга необходимо подтверждать диагноз расширенным анализом. Редкие варианты могут имитировать делецию SMN1. Ошибка на этом этапе ведёт к избыточной терапии и колоссальным затратам.

Источник: Brunhilde Wirth, et al. SMN1 variants identified by false-positive SMA newborn screening tests: Therapeutic hurdles and functional and epidemiological solutions // American Journal of Human Genetics. Published online February 12, 2026.